Рзн 2020/9957

Метод ПЦР

ПЦР — это метод полимеразной цепной реакции. О нем наслышаны многие, хотя до эпидемии значение аббревиатуры ПЦР было знакомо лишь криминалистам, генетикам, а также лабораторным работникам, определяющим ВИЧ, сифилис, гепатиты, туберкулез и еще ряд заболеваний.

Как работает ПЦР и какие бывают вирусы

ДНК — это двойная спираль, кодирующая генетическую информацию, в том числе, вирусов. Обе части ДНК соединены по принципу комплементарности. То есть, один элемент может соединяться только с соответствующим ему. Например, гуанин (G) только с цитозином(C). ДНК-содержащие вирусы — это вирус герпеса, оспы, гепатита В. Коронавирус относится к РНК-содержащим вирусам.

Для исследования методом ПЦР берется мазок из ротоглотки. Если в материал для анализа попала вирусная частица, то в лаборатории одна нить ее РНК достраивается до двойной спирали ДНК.

РИА Новости/Сергей Пивоваров

В чем суть метода ПЦР?

Вместо того, чтобы искать иголку в стоге сена (одну нить вирусной частицы), можно сделать целый «клубок» нитей, найти которые не составит труда. Нуклеотидная последовательность («буквы») РНК вируса уже расшифрована. И к этим «буквам» по принципу комплиментарности присоединяются в результате химической реакции другие. В итоге получается молекула ДНК. Она служит матрицей. Затем ее многократно размножают примерно по той же технологии. ДНК помещают в раствор со специальным набором химических веществ в устройство-амплификатор, в котором периодически меняется температура от 50 до 92 градусов. В нем, как в ксероксе, ДНК копируется.

Финальный этап исследования – электрофорез, на нем можно увидеть размноженные копии ДНК. ДНК заряжена отрицательно, и в электрическом поле ее притягивает положительный заряд. Притягиваясь к нему, размноженная ДНК проходит через краситель. Чем больше фрагмент ДНК, тем медленнее он двигается и тем ярче окрашивается.

Если в биоматериале пациента не было вирусной частицы, то и первая цепочка ДНК не выстроится – химическим веществам, подобранным для строительства, не за что будет «зацепиться». Соответственно, форез ничего не покажет.

КТ

Преимущество КТ-диагностики при наличии клинической картины – это  скорость постановки диагноза и более высокая чувствительность по сравнению с реальностью ПЦР-диагностики: 97,2 % против 83,3% согласно данным небольшого китайского исследования []. Начиная с 4-5 дня заболевания можно различить участки «матового стекла», на стадии прогрессирования такие участки консолидируются,  возникает симптом «булыжной мостовой», «обратного гало», а в пиковая стадии — «белое легкое» []. Возникает закономерный вопрос: отличается ли картина пневмонии, вызванной именно новым коронавирусом, от заболеваний другой вирусной природы. Ответ — нет. Вирусные пневмонии, будь то аденовирус, грипп или другие респираторные вирусы, выглядят на КТ одинаково.

Однако в условиях пандемии, когда подавляющее большинство вирусных пневмоний имеют коронавирусную природу, использование КТ для диагностики становится более чем оправданным.

 В последней версии методических рекомендаций Минздрава по профилактике, диагностике и лечению COVID-19 указано, что «наличие клинических проявлений в сочетании с характерными изменениями в легких по данным КТ или обзорной рентгенографии органов грудной клетки вне зависимости от результатов однократного лабораторного исследования на наличие РНК SARS-CoV-2 и эпидемиологического анамнеза» является клинически подтвержденным случаем COVID-19 []. Отметим также, что объем поражения легких при РГ и КТ может не соотносится с тяжестью состояния пациента.

ИФА

ПЦР-тест-системы, как и КТ-диагностика выявляет COVID-19 в острой фазе. Однако весьма актуальна и информация об уже переболевших, на основании которой можно судить об охвате населения заболеванием, а также о числе бессимптомных случаев. Ответы на эти, а также на многие другие вопросы, может дать тест-система на антитела. На сегодняшний день разрабаткой таких тест-систем помимо «Вектора» занимаются такие организации как «Вектор-Бест», ООО «НПО «Диагностические системы», ФНКЦ ФХМ ФМБА России, «МБС-Технологии», а также «Генетико» и Институт молекулярной биологии РАН . К сожалению, тест-системы на антитела требуют намного больших усилий и времени на разработку, чем ПЦР-системы, а их чувствительность и специфичность оставляет желать лучшего. Так, проведенное в США исследование доступных система на антитела показало, что лишь 3 из 14 систем дают надежные результаты (т.е. не более 1% ложноположительных результатов), но при этом их чувствительность не превышает 90% относительно положительных контрольных образцов []. Какова будет чувствительность и специфичность разрабатываемых российских систем — пока неизвестно.

Сделаем краткие практические выводы:

В первые пять дней болезни — ПЦР-диагностика будет достаточно эффективна
Идеальный вариант — тестирование с выездом на дом в тех лабораториях, которые используют системы с контрольными образцами,  о чем мы писали выше. 

Если тест дал отрицательный результат или прошло больше пяти дней от начала болезни, а симптомы сохраняются, то в этом случае поможет с диагностикой КТ; при этом пациентам важно напомнить о соблюдении всех меры предосторожности при нахождении в медицинских организациях. 

Проводить ИФА при текущей низкой точности — едва ли имеет смысл. 
Если симптомов нет, но был контакт, в принципе можно пройти ПЦР-диагностику, но лучше всего на 14 дней уйти на самоизоляцию и наблюдать за самочувствием.. Парадоксальным образом, нам известны истории, когда самих врачей, контактных по COVID-19, тестируют далеко не всегда и на самоизоляцию никто не отправляет
Вопросы финансирования диагностики и конечно кадровой политики (кто вообще останется работать?) не решены

Поэтому, еще раз напоминаем о важности соблюдения всех профилактических мер при контакте с пациентами

Парадоксальным образом, нам известны истории, когда самих врачей, контактных по COVID-19, тестируют далеко не всегда и на самоизоляцию никто не отправляет. Вопросы финансирования диагностики и конечно кадровой политики (кто вообще останется работать?) не решены

Поэтому, еще раз напоминаем о важности соблюдения всех профилактических мер при контакте с пациентами

Отвечаем на вопросы о системе НМиФО в прямых эфирах Вконтакте: https://vk.com/medznanie_ru 

Обсудить последние новости со всеми коллегами России вы можете в чатах:

• WhatsApp: https://chat.whatsapp.com/Izj3ZQ7aI36KK8e2dCjcm4
• Telegram: https://tglink.ru/joinchat/GWBPCkkLipQUnTbXrKqzGA

Регистрируйся на нашем сайте и получай доступ к актуальным образовательным вебинарам

Также читайте статьи: Каким будет сценарий эпидемии COVID-19 в РФ (графики для РФ, Италии, Южной Кореи и США), Правда и мифы о коронавирусе (COVID 19), Вопрос жаропонижающих при коронавирусе: только не НПВП или почему бы и нет?

Когда можно получить результат после проведения теста на коронавирус

При исследовании по методу ПЦР ответ можно получить в течение нескольких часов, а если случай сложный, то на это уйдет два дня.

Сдать мазок анонимно не получится. Если результат положительный, придется сидеть на карантине или пройти стационарное лечение — решение будет принимать доктор по степени тяжести заболевания. Кроме этого, будут выявлены все контактные лица, и они также будут проверены на наличие коронавируса.

В случае, когда у контактных результат отрицательный, придется повторить тест через 4 дня, поскольку велика вероятность ошибки из-за слишком раннего забора анализов.

Набор реагентов для выявления РНК SARS-CoV-2 методом петлевой изотермальной амплификации Изотерм SARS-CoV-2 РНК-скрин по ТУ 21.20.23-069-26329720-2020

Сведения из Государственного реестра медицинских изделий:

Уникальный номер реестровой записи
48459
Регистрационный номер медицинского изделия
РЗН 2020/9957
Дата государственной регистрации медицинского изделия
26.11.2020
Наименование медицинского изделия
Набор реагентов для выявления РНК SARS-CoV-2 методом петлевой изотермальной амплификации «Изотерм SARS-CoV-2 РНК-скрин» по ТУ 21.20.23-069-26329720-2020в составе: Компоненты: «К+» – положительный контроль — 1 пробирка (100 мкл), «К-» – отрицательный контроль — 1 пробирка (100 мкл), «РС» – реакционная смесь — 1 пробирка (1,5 мл), «Фермент» – Bst-полимераза — 1 пробирка (130 мкл), «Лизирующий буфер» – 1 флакон (12,0 мл), Планшет 96-луночный для проведения ПЦР — 1 шт., Пленка для запаивания планшета 96-луночного — 1 шт. Эксплуатационная документация: Инструкция по применению набора реагентов — 1 шт.
Наименование организации — заявителя медицинского изделия
АО «ГЕНЕРИУМ»
Место нахождения организации-заявителя медицинского изделия
601125, Россия, Владимирская область, Петушинский район, п. Вольгинский, ул. Заводская, стр. 273
Юридический адрес организации-заявителя медицинского изделия
601125, Россия, Владимирская область, Петушинский район, п. Вольгинский, ул. Заводская, стр. 273
Наименование организации-производителя медицинского изделия или организации-изготовителя медицинского изделия
АО «ГЕНЕРИУМ»
Место нахождения организации-производителя медицинского изделия или организации — изготовителя медицинского изделия
601125, Россия, Владимирская область, Петушинский район, п. Вольгинский, ул. Заводская, стр. 273
Юридический адрес организации-производителя медицинского изделия или организации — изготовителя медицинского изделия
601125, Россия, Владимирская область, Петушинский район, п. Вольгинский, ул. Заводская, стр. 273
Код Общероссийского классификатора продукции для медицинского изделия
21.20.23.110
Класс потенциального риска применения медицинского изделия в соответствии с номенклатурной классификацией медицинских изделий, утверждаемой Министерством здравоохранения Российской Федерации
3 (медицинские изделия с высокой степенью риска)
Вид медицинского изделия в соответствии с номенклатурной классификацией медицинских изделий, утверждаемой Министерством здравоохранения Российской Федерации

Адрес места производства или изготовления медицинского изделия
1. АО «ГЕНЕРИУМ», Россия, 601125, Владимирская область, Петушинский район, п. Вольгинский, ул. Заводская, стр. № 263.2. АО «ГЕНЕРИУМ», Россия, 601125, Владимирская область, Петушинский район, п. Вольгинский, ул. Заводская, стр. 273.3. ООО «Медико-биологический Союз», Россия, 630090, г. Новосибирск, ул. Инженерная, д. 16.

Когда делают тест по методу ПЦР?

Сделать ПЦР тест на коронавирус можно любому человеку даже без видимых у него симптомов заболевания. Если вирус проник в организм, тестирование это покажет. Но сегодня его делают далеко не всем желающим. Направляют на тест только врачи и в приоритете следующие группы населения:

• граждане с признаками простуды или гриппа, прибывшие в ближайшие 2 недели из стран, неблагополучных по коронавирусной ситуации, а также контактировавшие с ними лица;
• лица старше 60 лет, обратившиеся к врачу с признаками ОРВИ;
• все, кому поставлен диагноз «пневмония» в ближайшие дни;
• лица с хроническими заболеваниями: сердечно-сосудистыми, эндокринными, онкологическими;
• контактировавшие с гражданами, у кого диагноз COVID‑19 подтвердился.

Так же на анализ направляют при обнаружении положительного результата при прохождении экспресс-теста.

Как и когда пациенты узнают о результатах?

В среднем на получение ответа при исследовании по методу ПЦР отводится от нескольких часов до двух дней. При любом результате пациента извещает медицинское учреждение, направившее его на анализ.

В случае положительного ответа принимается решение о помещении его на домашний карантин или на лечение в стационар в зависимости от тяжести протекания заболевания. Обязательно устанавливается круг лиц, с кем в ближайшее время заболевший контактировал. У них производится забор материала для проведения теста на коронавирус.

В случае отрицательного результата рекомендуется повторить тест через 4 дня от первого забора материала на анализ. Не исключается вероятность, что заражение произошло, но диагностика проведена слишком рано.

Российские тест-системы по методу ПЦР

Отечественные лаборатории активно включились в процесс разработки тестов на определение коронавирусной инфекции.

Узнать подробнее, где сдать тест на коронавирус и антитела к нему, а также о его стоимости, можете ознакомиться на этой странице.