Рнк sars cov 2 качественное определение

Подготовка к диагностике

Для получения достоверных результатов важно соблюдать правила подготовки к забору биоматериала. Перед мазком из зева и носа нельзя кушать, чистить зубы, курить и жевать резинку в течение 2 часов, на протяжении последних 30 минут не пить воду

Также на протяжении последних 2 часов рекомендуют не использовать капли/спреи в нос, горло. Если наблюдается большое количество вязкого секрета, то перед проведением мазка нужно высморкаться.

Забор венозной крови проводят утром натощак либо не ранее, чем через 6-8 часов с момента последнего приема пищи. Пить воду на протяжении этого времени можно. Если пациент принимал в течение 2 последних недель препараты, влияющие на состояние иммунной системы (Амиксин, Тилорон-С3), необходимо сообщить об этом лаборанту. Тот сделает соответствующие пометки на бланке анализа.

Принципы проведения качественного анализа на ВГC

В целом, к пациенту не имеется особых требований по подготовке к сдаче анализов. Все, что нужно сделать – сдать небольшое количество крови. Строго рекомендуется делать это натощак: в этом случае результаты диагностики будут более точными.

Стоит знать, что качественный анализ по методу ПЦР обычно назначается не сразу. Его рекомендуют проводить в следующих случаях:

• Обнаружение антител вируса гепатита C в крови пациента.
• Был обнаружен ВГC, но антитела в крови не имеются.
• При контроле проводимой противовирусной терапии.

В первых двух случаях качественный анализ назначается после сероконверсии. Если антител нет, но вирус обнаружен, нужно понять: какой именно генотип ВГC присутствует, и почему иммунная система не реагирует. Если есть антитела, то анализ позволяет разобраться: нужно ли лечение, или организм самостоятельно поборол болезнь.

Наконец, при контроле противовирусной терапии анализ делается для проверки эффективности лечения. В частности, метод ПЦР позволит понять, как препараты воздействуют на уже обнаруженный ВГC. Если эффект слабый, то на основе анализов врач решает, нужно ли менять лечение. Стоит запомнить: при контроле противовирусной терапии требуется особо чувствительное оборудование, способное обнаружить РНК гепатита C даже в самой низкой концентрации.

Обнаружение нуклеиновых кислот

Анализ на наличие нуклеиновых кислот является предпочтительным методом диагностики SARS-CoV-2. Процедура тестирования согласно приведенным в наборе инструкциям выглядит следующим образом: образцы подвергаются предварительной обработке, вирус подвергается лизису для выделения нуклеиновых кислот. Три специфических гена SARS-CoV-2, а именно: открытая рамка считывания 1a/b (ORF1a/b), гены нуклеокапсидного белка (N) и белка оболочки (E) затем амплифицируются по методике количественной ПЦР в реальном времени.

Амплифицированные гены обнаруживаются по интенсивности флуоресценции. Критерии положительных результатов анализа на нуклеиновые кислоты: положительный тест на ген ORF1a/b и (или) ген N (ген E).

Комбинированное обнаружение нуклеиновых кислот из разных типов образцов может повысить точность диагностики. Среди пациентов с подтвержденным положительным анализом на нуклеиновую кислоту в дыхательных путях около 30%–40% также показали нуклеиновую кислоту вируса в крови и около 50%–60% в кале. В то же время доля положительных анализов в образцах мочи была довольно низкой. Комбинированное тестирование, включающее образцы отделяемого из дыхательных путей, фекалий, крови и др. помогает повысить чувствительность диагностики у пациентов с подозрением на новую коронавирусную инфекцию, лучше контролировать эффективность лечения и определять меры изоляции после выписки.

Что показывает анализ?

Определение РНК нужен, чтобы узнать, есть ли в крови вирусные клетки. Содержимое ядра этого возбудителя имеет морфологические особенности строения, уникальное соединение нуклеотидов между собой, что выявляется ультра микроскопическим методом. Понятие «качественно» обозначает не высокий уровень исследования, а то, что результаты анализа не обозначаются в числовых показателях, а говорят лишь о наличии или отсутствии возбудителя гепатита в кровеносном русле.

Альтернативный метод для биопсии. Эта методика за 10 лет развития постоянно усовершенствуется и дает более точные результаты. Следует отметить, что вирусы постоянно мутируют с появлением новых подвидов. Существует 6 видов различных по структуре генотипов гепатита С, что значительно усложняет интерпретацию результатов обследования. Чтобы выявить все патологические частицы, нужно уметь различать и распознать эти генотипы. Для этого используется множество реактивов и приспособлений, способных выявить мельчайшие вирусы на ранних этапах развития.

Лечение коронавирусной инфекции COVID-19

Эффективным способом лечения пневмонии, вызванной коронавирусом в Китае, оказалась экстракорпоральная оксигенация, которую применили к пациентам китайские специалисты. Поскольку воспаленные легкие не в состоянии обеспечить организм нужным количеством кислорода, последний вводится извне, минуя легкие, что дает возможность поддержать работу жизненно важных органов.

Помочь облегчить (но не повысить эффективность борьбы организма с вирусом!) общее состояние пациентов могут лекарства для снижения температуры — жаропонижающие (парацетамол, ибупрофен). Назначается дезинтоксикационная инфузионная терапия, применяются витамины. Глюкокортикостероиды не только не эффективны, но и усугубляют состояние больных из-за подавления иммунитета, поэтому их не применяют.

В первые дни болезни иммунитет не реагирует на вирус, не образует в нужном количестве защитные антитела и клетки, способные обезвредить возбудителя. Позднее антитела появятся и будут еще долгое время циркулировать в кровотоке. Этот факт лег в основу новейшего метода лечения коронавируса — переливание плазмы с антивирусными белками выздоровевших пациентов вновь заболевшим.

Чувствительность тестов и частота их проведения

Тест обладает высокой чувствительностью к РНК вируса гепатита С. Он может выявить даже самый минимальный уровень содержания болезни в крови. При этом количественный анализ способен точно описать, сколько генетической информации об этой проблеме содержится в организме.

Тест проводится несколько раз в течение болезни:

• Перед началом терапии для правильного определения состояния организма в целом и молекулярной структуры отдельного вида заболевания. Это позволяет назначить правильное лечение.
• В ходе терапии, на 4 неделе, а потом и на 24. Изменение уровня болезни в нужном участке молекулы ДНК является сигналом того, насколько правильно построено лечение.
• После терапии, когда подводится итог, и лечащему специалисту необходимо убедиться, что все гены пациента больше не содержат следов патологии.

Иногда приходится также повторять тест через три месяца, полгода и год. Избегать этих проверок не следует — это значит подвергать опасности окружающих.

Расшифровка результатов

Интерпретацией полученных данных занимается врач, который дал направление на диагностику. Если пациент самостоятельно решил пройти обследование, то с бланком следует обратиться к специалисту.

ПЦР

В бланке с результатами обычно значится одно слово – «положительный» либо «отрицательный». «Положительный» ответ говорит о наличии в организме человека возбудителя коронавирусной инфекции. Данные такого анализа обязательно передаются в лабораторный центр Министерства здравоохранения. Пациенту необходимо соблюдать условия самоизоляции и сообщить своему семейному врачу о положительном результате.

«Отрицательный» ответ говорит об отсутствии возбудителя КВИ в биоматериале, который был сдан в качестве образца для исследования. Такой итог не является диагнозом, а значит, если есть какие-либо признаки ОРВИ или острого респираторного синдрома, необходимо обратиться к врачу.

Тест на антитела

Ответы могут быть следующими:

• «первично положительный»;
• «положительный»;
• «отрицательный».

При «первично положительном» результате анализа на антитела IgA/IgМ/IgG специалисты советуют не впадать в панику, а пройти ПЦР-исследование на КОВИД-19. «Положительный» ответ говорит о том, что человек болен сейчас или был инфицирован в прошлом, что зависит от показателей той или иной группы иммуноглобулинов. Наличие иммуноглобулина М говорит об остром инфекционном процессе, то есть пациент болеет в данный момент времени. Если найдены иммуноглобулины M и G, это является свидетельством того, что особа уже переболела либо находится на этапе выздоровления.

IgM: < 1IgG: < 10	IgM: от 1 до 2IgG: < 10	IgM: ≥ 2IgG: < 10	IgM: ≥ 2IgG: ≥ 10	IgM: < 2IgG: ≥ 10
не сталкивался с вирусом	сомнительный результат	в стадии заболевания	сомнительный результат	переболел

Интерпретация результатов исследования

К примеру, если по результатам теста выявлены показатели IgM: 1.42 и IgG: 154.15 — это означает, что человек переболел коронавирусом и у него выработался хороший иммунитет. Показатели IgM: 5.12 и IgG: 9.51 свидетельствуют о процессе заболевания и необходимости соблюдать самоизоляцию.

Следует помнить, что наличие антител в организме человека не говорит именно о том, что он болеет COVID-19. Это всего лишь косвенный признак, который необходимо подтвердить ПЦР-исследованием, поскольку не только коронавирус может вызывать иммунную реакцию организма, но и ряд других не менее опасных инфекций.

Экспресс-метод

На тесте есть контрольная линия (С), она в любом случае должна в ходе исследования закрашиваться. Если этого не происходит, значит, тест недействителен, возможно, бракован

Такие результаты во внимание не берутся. Отрицательный тест будет в том случае, если закрашенной окажется только контрольная линия, а остальные (IgM, IgG) останутся в своем первоначальном виде

Положительным считается ответ:

• закрашена линия IgM + контрольная;
• закрашена линия IgG + контрольная;
• обе линии закрашены + контрольная.

Важно! Интенсивность окрашивания линий может быть различной.

Причины

Первоисточником инфекции были летучие мыши, однако, на сегодняшний день, главный источник (резервуар) SARS-CoV-2 – инфицированные люди.

Согласно исследований1 группы греческих врачей D.Paraskevis, G.Magiorkinis и прочих, новый коронавирус SARS-CoV-2 на 96,3% генетически схож на коронавирус летучих мышей BatCoV «RaTG13», что наталкивает на первопричину заражения человека.

Заражение коронавирусом SARS-CoV-2 происходит следующими путями:

• Воздушно-капельный (аэрогенный) – переносится с потоками воздуха, особенно если вблизи находится чихающий или кашляющий носитель инфекции. Также, микрокапельки носителя при кашле или чихании могут попадать на разные поверхности, после контакта с которыми здоровый человек может прикоснуться к глазам, рту и другим частям лица и также заболеть;
• Фекально-оральный путь (алиментарный) – инфекция во внешнюю среду попадает из ЖКТ, а после через зараженную воду или продукты вновь в организм человека.
• Контактно-бытовой – заражение происходит при использовании предметов гигиены или личных больного, особенно в случае контакта грязных вещей со слизистыми или открытыми ранами здорового человека.

В группу риска входят:

• Медперсонал;
• Лица, проживающие в плохих санитарных условиях;
• Лица с ослабленным иммунитетом;
• Лица, употребляющие в пищу змей, летучих мышей и других экзотических животных.

Заразность

Контагиозность (заразность) нового китайского коронавируса по отношению к другим вирусным инфекциям составляет:

• R0 Вирусы гриппа Influenzavirus — 1-2;
• R0 Коронавирус SARS-CoV-2 — 3,3-3,5;
• R0 Вирус кори Measles morbillivirus — 12-18.

R0 — базовое репродуктивное число, т.е. количество людей, которых носитель инфекции способен заразить вокруг себя.

Исходя из вышеперечисленных данных можно сделать вывод, что SARS-CoV-2 в 3 раза заразнее гриппа, но в тоже самое время в 4-5 раз менее заражен кори.

Что такое дезоксирибонуклеиновая кислота?

ДНК — это нуклеиновая кислота, состоящая из двух нитей, которые соединены по закону комплементарности водородными связями азотистых оснований. Длинные цепи закручены в спираль, один виток содержит почти десять нуклеотидов. Диаметр двойной спирали составляет два миллиметра, расстояние между нуклеотидами — около половины нанометра. Длина одной молекулы порой достигает нескольких сантиметров. Длина ДНК ядра человеческой клетки составляет почти два метра.

В структуре ДНК содержится вся генетическая информация. ДНК обладает репликацией, что означает процесс, в ходе которого из одной молекулы образуются две совершенно одинаковые — дочерние.

Как уже было отмечено, цепь складывается из нуклеотидов, состоящих, в свою очередь, из азотистых оснований (аденина, гуанина, тимина и цитозина) и остатка кислоты фосфора. Все нуклеотиды различаются азотистыми основаниями. Водородная связь возникает не между всеми основаниями, аденин, к примеру, может соединяться только с тимином или гуанином. Таким образом, адениловых нуклеотидов в организме столько же, сколько тимидиловых, а число гуаниловых равно цитидиловым (правило Чаргаффа). Получается, что последовательность одной цепочки предопределяет последовательность другой, и цепи как бы зеркально отражают друг друга. Такая закономерность, где нуклеотиды двух цепей располагаются упорядоченно, а также соединяются избирательно, называется принципом комплементарности. Кроме водородных соединений, двойная спираль взаимодействует и гидрофобно.

Две цепи разнонаправлены, то есть расположены в противоположных направлениях. Поэтому напротив трех’-конца одной находится пяти’-конец другой цепи.

Внешне молекула ДНК напоминает винтовую лестницу, перилом которой является сахарофосфатный остов, а ступеньками — комплементарные основания азота.

Расшифровка анализа на определение РНК гепатита С

Когда анализируется РНК, результаты HCV, необходимые для правильного лечения, включают в себя три основных пункта:

• Положительный или отрицательный результат дал качественный анализ на гепатит РНК. В этом случае, что значит получение положительного результата: в первую очередь, вероятность заражения для окружающих. При этом положительный HCV может указывать также на недавно перенесённый острый приступ заболевания, при котором в организме ещё остались следы. Однако, если результаты показывают, что не обнаружено следов этой патологии, это почти всегда значит, что пациент здоров. Иногда на начальном этапе болезнь может быть не выявлена. Это происходит из-за того, что тест может демонстрировать результат «РНК гепатита не обнаружено», если его содержание в крови крайне мало.
• Количество рибонуклеиновых кислот, когда тест все же дал положительный результат. Он позволяет определить то, насколько сильно успело развиться заболевание.
• Конкретный вид заболевания. Если расшифровываются тесты на гепатит, определение его вида — одно из важнейших условий для правильного лечения. Даже существующие в России типы этой болезни требуют разницы в подходе, и терапия в каждом отдельном случае будет выглядеть по-разному. Особенно сложной ситуация станет, если пациент болен каким-либо экзотическим видом. В результатах это часто отмечается прочерком в графе определения типа и требует дополнительного осмотра.

Лечение коронавируса SARS-CoV-2 (2019-nCoV)

Оптимальную схему лечения нового коронавируса SARS-CoV-2 (заболевание COVID-19) врачи различных стран все еще разрабатывают. Некоторые ученые, например в Японии утверждают, что уже нашли сыворотку от данного вируса.

Однако, пока специфические противовирусные препараты разрабатываются, все сходятся во мнении, что прежде всего терапия должна быть направлена на поддержание функций жизненно-важных органов, т.е. применяется симптоматическое лечение.

1. Медикаментозное лечение

Министерство Здравоохранения РФ 03.02.2020 г. опубликовало временные методические рекомендации по лечению вирусной инфекции COVID-19, в которой указаны следующие противовирусные препараты против этого вируса – «Рибавирин», «Лопинавир/Ритонавир», «Рекомбинантный интерферон бета-1b».

Для контроля за температурой тела- если она повышается до критических отметок (40 °С и выше) или не проходит в течение нескольких дней, держась на уровне 38,5 °С у взрослых и 38 °С у детей, применяются жаропонижающие лекарства — «Парацетамол».

В начале вспышки болезни применяли лекарства из группы нестероидные противовоспалительные препараты (НПВС) – «Ибупрофен», «Нурофен», «Нимесил» и прочие, однако от них выявлен эффект усиления течения болезни и появления осложнений, поэтому Ибупрофен и прочие средства при лечении КОВИД-19 запрещен.

При средне-тяжелом и тяжелом поражении проводится дезинтоксикационная терапия, целью которой является очищение организма, в частности, крови от продуктов инфекционного поражения, состоящих из самих микробов, а также продуктов их жизнедеятельности в организме. Для детоксикации организма применяются растворы глюкозы («Декстроз»), электролитов (полиионные растворы), «Декстран», растворы кристаллоидов, «Гидрокарбоната натрия». После этих средств применяются диуретики (мочегонные средства) – «Фуросемид», «Маннитол».

Применение диуретиков также способствует снижению отечности в легких, частично профилактируя тем самым обструкцию дыхательных путей.

При сильном насморке и заложенности носа, выраженной отечности носовых ходов назначаются сосудосуживающие капли — «Фармазолин», «Отривин», «Нокспрей» и прочие.

При нарушении дыхательной функции применяют ИВЛ (искусственная вентиляция воздуха), а при необходимости делают интубацию трахеи.

Китайские медики также с успехом испробовали лечить пневмонию, вызванную SARS-CoV-2 экстракорпоральной оксигенацией, суть которого заключается в искусственном насыщении крови кислородом, тем самым улучшив дыхательную функцию организма.
Гормональные препараты (глюкокортикостероиды) при COVID-19 в отличие от пневмонии, вызванной SARS-CoV-1 и MERS-CoV применять не рекомендуется, т.к. замечен незначительный результат по снятию воспалительного процесса, но, в это же время, гормоны замедляли действие иммунитета по купированию нового коронавируса.

Антибиотики против вирусной инфекции также не назначаются, поскольку они не обладают против них никаким пагубным действием, а вот дополнительно понизить реактивность иммунитета при их применении вполне возможно. Назначение антибактериальных препаратов целесообразно лишь при вторичной бактериальной инфекции.

2. Диета при COVID-19

Цель диетического питания при коронавирусах – поддержать организм и аккумулировать его силы на борьбу с инфекцией.

При ОРВИ, пневмонии и других инфекционных заболеваниях дыхательной системы назначается диета №13 (стол №13).

При данной диете не рекомендуется к употреблению жирного, острого, жаренного, копченостей, крепкого чая, кофе, и конечно же, алкогольной продукции.

Диагностика

Подозрительным на COVID-19 случаем считается случай, при котором присутствуют:

• признаки острого респираторного вирусного заболевания, бронхита или пневмонии;
• наличие в анамнезе посещения неблагополучных по COVID-19 регионов или стран;
• были тесные контакты с лицами, которые впоследствии заболели (SARS-CoV-2 подтвержден лабораторно).

К вероятным случаям относят лиц с симптомами пневмонии, острого респираторного дистресс-синдрома или сепсиса в сочетании с эпидемиологически неблагополучным анамнезом.

Подтвержденным случаем считается лабораторное подтверждение методом ПЦР инфицирования SARS-CoV-2 независимо от наличия или отсутствия симптомов заболевания.

Диагностика коронавируса основана на:

• Изучении эпидемиологического анамнеза – уточняется, находился ли пациент в течение последних 14 дней до появления симптомов в очаге эпидемии, были ли контакты с лицами, болеющими коронавирусом или ОРВИ.
• Клинической картине заболевания. Проверяется, присутствуют ли признаки дыхательной недостаточности, измеряется содержание кислорода в крови (признак гипоксемии – уровень менее 90% для взрослого при пульсоксиметрии), оцениваются гемодинамические нарушения, гематологические изменения, синдром полиорганной недостаточности (развивается вследствие системного воспалительного процесса организма. Также изучается развернутый анализ крови, который при COVID-19 характеризуется снижением уровня лейкоцитов, лимфоцитов и тромбоцитов. Для оценки тяжести состояния изучают уровень активности печеночных ферментов (АЛТ, АСТ), коагулопатических маркеров, протромбина, МНО, Д-димера, прокальцитонина, пресипсина, СРБ.

Обследование включает:

• Тест на коронавирус, для которого берется назофарингеальный мазок, позволяющий выявить при помощи метода ПЦР антигены к SARS-CoV-2 и других известных возбудителей, вызывающих респираторные инфекции (грипп А и В, парагрипп, аденовирусы, риновирусы, бокавирусы, SARS и MERS, сезонные коронавирусы, метапневмовирусы, респираторно-синцитиальный вирус). Экспресс-тест позволяет выявить антитела к коронавирусу, которые появляются на 3-7 день заболевания, поэтому они используются для предварительной диагностики.
• Общий анализ крови и мочи.
• Биохимический анализ крови.
• Анализ мокроты.
• Рентгенографию органов грудной клетки.

В качестве биологического материала для исследования используют назофарингеальный аспират, промывные воды бронхов, кровь, мочу, мокроту, аутопсийный материал легких. Биообразцы, которые считаются потенциально инфекционными, хранятся при температуре от +2 до +8 в течение суток.

Прямая трансляция карты распространения коронавируса и случаев заражения / смертей по странам

Стоит отметить, что коронавирусная инфекция — не такая уж редкость и в повседневности. На ее долю приходится около 12% всех ОРВИ, которые диагностируются у пациентов, нуждающихся в госпитализации,80% людей уже имеют антитела к вирусу, свидетельствующие о встрече с возбудителем в прошлом

структура коронавирусного вириона

Коронавирус SARS-CoV-2 содержит одну цепочку РНК, окруженную оболочкой из белка и липидов. Снаружи возбудитель снабжен своеобразными шипами, образующими подобие короны, с помощью которой он фиксируется на рецепторах мембран клеток-мишеней. Вирусные белковые «шипы» клетка ошибочно принимает за необходимые для ее метаболизма молекулы и связывается с ними, позволяя вирусу беспрепятственно ввести в клетку свою РНК.

Описанный механизм прослеживается не только у нового коронавируса, но и у других возбудителей этого семейства, вызывавших тяжелые респираторные нарушения ранее. Так, коронавирус атипичной пневмонии и нынешний фиксируются к одному и тому же рецептору клеточной мембраны. Новый вирус, в отличие от своего «собрата», отличается более высокой заразностью, но при этом смертность от него в разы ниже.

Благодаря своей «короне» вирус становится устойчивым к иммунитету, который расценивает его не как инфекцию, а нужную для обмена молекулу белка и потому не уничтожает. После внедрения РНК пораженная клетка-мишень начинает синтезировать вирусные протеины, обеспечивая стремительное размножение возбудителя. После выхода готового коронавируса из клетки, последняя гибнет.

В клетках человека коронавирус SARS-CoV-2 чувствует себя комфортно и в безопасности от иммунных реакций, однако во внешней среде он быстро погибает. Причина — все та же «корона» из белка, который быстро разрушается от действия кислорода. Устойчивость вирус приобретает при высушивании и хранении при температуре +4 градуса либо при глубокой заморозке. В воде он может прожить 9 суток, но от действия солнечных лучей погибает за четверть часа. Пагубно влияют на него растворители жиров, поверхностно активные обезжиривающие средства, высокая температура и этанол, убивающий коронавирус за полминуты после обработки кожи спиртовым антисептиком.

Вопрос устойчивости нового коронавируса важен не только с позиций лечения и профилактики заражения. Китай имеет обширные торговые связи, отправляя продукцию массового потребления в виде посылок во все уголки мира. В связи с эпидемией, вызванной китайским коронавирусом, было приостановлено авиасообщение с некоторыми областями страны, а также работа почты, что серьезно сказалось на экономике Китая, а в итоге – и мировой.

К счастью, коронавирус не выживает при пересылке чего бы то ни было почтой даже в том случае, если мокрота или слизь из носа при чихании заболевшего будет упакована вместе с товаром герметично. Спустя двое суток живого и заразного вируса в посылке не будет точно, поэтому риск заражения равен нулю, что подтверждает и Всемирная организация здравоохранения.

Функции РНК

В основе функций рибонуклеиновой кислоты лежат три различных вида РНК.

Информационная передает генетическую информацию от ДНК в цитоплазму ядра. Ее еще называют матричной. Это незамкнутая цепь, синтезирующаяся в ядре при помощи фермента РНК-полимеразы. Несмотря на то что в молекуле ее процентное содержание чрезвычайно низкое ( от трех до пяти процентов клетки), на ней лежит важнейшая функция — являться матрицей для синтеза белков, информируя об их структуре с молекул ДНК. Один белок кодируется одной специфичной ДНК, поэтому их числовое значение равное.

Рибосомная в основном состоит из цитоплазматических гранул — рибосом. Р-РНК синтезируются в ядре. На их долю приходится примерно восемьдесят процентов всей клетки. Этот вид обладает сложной структурой, образовывая петли на комплементарных частях, что ведет к молекулярной самоорганизации в сложное тело. Среди них имеются три типа у прокариот, и четыре — у эукариот.

Транспортная действует в роли «адаптера», выстраивая в соответствующем порядке аминокислоты полипептидной цепи. В среднем, она состоит из восьмидесяти нуклеотидов. В клетке их содержится, как правило, почти пятнадцать процентов. Она предназначена переносить аминокислоты туда, где белок синтезируется. В клетке насчитывается от двадцати до шестидесяти типов транспортной РНК. У них всех — сходная организация в пространстве. Они приобретают структуру, которую называют клеверным листом.

Эпидемиология

Основной источник инфекции – больной человек на всех этапах заболевания, включая инкубационный период. Вирус начинает выделяться за 48 часов до появления первых симптомов и достигает максимального количества в первые 3 дня болезни. При легком и умеренном течении заболевания выделение вируса происходит в течение 12 дней, в тяжелых продолжается более 2-х недель.

При близком контакте с больным риск заражения составляет 1-5% (в 75-85% случаев передача возбудителя происходит в семейном очаге).

Распространение инфекции происходит:

• воздушно-капельным путем при разговоре, чихании и кашле;
• контактно-бытовым путем (коронавирус сохраняется на медных и алюминиевых поверхностях в течение 2-8 часов, на медицинских перчатках – 8 ч, обработанные деревянные поверхности представляют опасность в течение 2-х суток, стеклянные поверхности и банкноты – до 4-х дней, бумага – до 3-х часов, нержавеющая сталь и пластик – до 7 дней, медицинские маски – 7 дней).

Согласно исследованиям гонконгских ученых, SARS-CoV-2 сохраняет высокую стабильность при температуре +4 градуса и при отсутствии дезинфекции начинает терять активность лишь спустя 14 дней. При температуре +70 коронавирус гибнет в течение 5 мин.

Фекально-оральный путь распространения вируса возможен (SARS-CoV-2 сохраняется в фекалиях), но на практике этот способ заражения в настоящее время не наблюдается.

Подтвержден лабораторно артифициальный механизм передачи (медицинские манипуляции) SARS-CoV-2 – заражение медицинского персонала, который оказывает помощь больным с коронавирусом, наблюдается во многих странах.

Поскольку SARS-CoV-2 – новый для человека возбудитель, к нему восприимчивы все группы населения. Легкая форма заболевания наблюдается у 80-85% пациентов.

Летальность составляет по сегодняшним оценкам 3-5,3%, но в настоящее время не известно точное количество случаев бессмптомного носительства и легких форм болезни (точные данные могут существенно изменить статистику).

К группам риска тяжелого течения COVID-19 относятся люди с:

• кардиологическими патологиями (подтвержденные случаи летального исхода у пациентов с данной патологией – 13,2%);
• диабетом (9,2%);
• хроническими респираторными заболеваниями (8,0%);
• гипертензией (8,4%);
• онкологическими заболеваниями (7,6%).

Риск тяжелого течения коронавируса при других хронических патологиях в настоящее время не известен.

Летальные исходы при коронавирусе чаще наблюдаются у мужчин, чем у женщин (подтвержденные случаи у мужчин составляют 4,7%, а у женщин – 1,7%). Такое соотношение может быть связано с курением, которое увеличивает риск респираторных осложнений и больше распространено среди мужчин.

Риск летального исхода также зависит от возраста. Он составляет:

• 21,9% для больных старше 80 лет;
• 8% для пациентов от 70 до 79 лет;
• 3,6% для возрастной группы от 60 до 69 лет;
• 1,3% для больных 50-59 лет;
• 0,4% для возрастной группы от 40 до 49 лет;
• 0,2% для пациентов от 10 до 39 лет.

COVID-19 считается безопасным для детей от 0 до 9 лет.

Патогенез заболевания в настоящее время до конца не изучен.

Техника безопасности

Защитные меры биобезопасности принимаются в соответствии с уровнем риска экспериментального процесса. Индивидуальная защита применяется в соответствии с требованиями лабораторной защиты BSL-3 (соответствует 2 уровню биологической безопасности в России – Прим. пер.) для сбора образцов отделяемого из дыхательных путей, исследования на наличие нуклеиновых кислот и действий по культивированию вируса. Средства индивидуальной защиты в соответствии с требованиями лабораторной защиты BSL-2 (соответствует 3 уровню биологической безопасности в России – Прим. пер.) применяются при биохимических, иммунологических исследованиях и других обычных лабораторных исследованиях. Образцы следует перевозить в специальных транспортных контейнерах, отвечающих требованиям биобезопасности. Все лабораторные отходы только автоклавируются.

Транспортная рибонуклеиновая кислота

т-РНК наиболее изучены. Они составляют десять процентов клеточной рибонуклеиновой кислоты. Эти виды РНК связываются с аминокислотами благодаря специальному ферменту и доставляются на рибосомы. При этом аминокислоты переносятся транспортными молекулами. Однако бывает, что аминокислоту кодируют разные кодоны. Тогда переносить их будут несколько транспортных РНК.

Она сворачивается в клубочек, когда неактивна, а функционируя, имеет вид клеверного листа.

В ней различаются следующие участки:

• акцепторный стебель, имеющий последовательность нуклеотидов АЦЦ;
• участок, служащий для присоединения к рибосоме;
• антикодон, кодирующий аминокислоту, которая присоединена к этой т-РНК.

Исследование показателей воспалительного процесса

Рекомендуется проводить анализы на содержание С-реактивного белка, прокальцитонина, ферритина, D-димера, общих лимфоцитов и субпопуляций лимфоцитов, интерлейкинов IL-4, IL-6, IL-10, TNF-α, INF-γ и других индикаторов воспаления и иммунного статуса, что может помочь оценить клиническое развитие, предупредить серьезные и критические тенденции и послужить основой для разработки стратегии лечения.

У большинства больных с CОVID-19 наблюдается нормальный уровень прокальцитонина при значительно повышенном уровне С-реактивного белка. Быстро и значительно растущий уровень С-реактивного белка указывает на возможность вторичной инфекции. Уровень D-димера значительно повышается в тяжелых случаях, что является потенциальным фактором риска и основанием для плохого прогноза. У пациентов с низким общим количеством лимфоцитов в начале заболевания, как правило, плохой прогноз. У тяжелых больных прогрессивно снижается количество лимфоцитов периферической крови. У пациентов с тяжелым течением болезни значительно повышен уровень экспрессии IL-6 и IL-10. Мониторинг уровня IL-6 и IL-10 полезен для оценки риска перехода заболевания в тяжелую форму.

Виды анализов и их отличия

Основным анализом, определяющим содержание в крови РНК гепатита С, является HCV. Для него берётся кровь из вены, и такой метод называется также ПЦР. Определение методом ПЦР обнаруживает нуклеиновые элементы в крови, принадлежащие С-вирусу.

Существует два вида исследований РНК заболевания:

Определение методом ПЦР обнаруживает нуклеиновые элементы в крови, принадлежащие С-вирусу

1. Качественное исследование. Позволяет определить, заражен ли пациент вообще инфекцией. Определение РНК этого заболевания почти всегда возможно, если болезнь зашла достаточно далеко. Ошибки могут возникнуть только на самом начальном этапе развития патологии, когда содержание её частиц в крови ещё слишком мало, чтобы быть обнаруженным и определенным.
2. Количественное HCV-исследование. Это второй этап анализа, когда качественное исследование уже показало, что у пациента возникли проблемы. Количественный анализ позволяет определить, как сильно развилась болезнь.

Кроме того, после количественного проводится генотипическое исследование, с помощью которого можно также выяснить, каким именно видом болезни страдает пациент. В России активно распространены всего три, и схемы лечения различаются.

Примечания

1. Lee T. I., Young R. A. Transcriptional regulation and its misregulation in disease. (англ.) // Cell. — 2013. — Vol. 152, no. 6. — P. 1237—1251. — DOI:10.1016/j.cell.2013.02.014. — PMID 23498934.
2. Merry, C. R., Forrest, M. E., Sabers, J. N., Beard, L., Gao, X. H., Hatzoglou, M., … & Khalil, A. M. DNMT1-associated long non-coding RNAs regulate global gene expression and DNA methylation in colon cancer // Human molecular genetics. — 2020. — Т. 24, № 21. — С. 6240-6253. — DOI:10.1093/hmg/ddv343.
3. Managing Methylation
4. Daniel Holoch & Danesh Moazed. RNA-mediated epigenetic regulation of gene expression // Nature reviews. Genetics. — 2020. — Т. 16, № 2. — С. 71–84. — DOI:10.1038/nrg3863. — PMID 25554358.
5. Jeffrey J. Quinn & Howard Y. Chang. Unique features of long non-coding RNA biogenesis and function // Nature reviews. Genetics. — 2020. — Т. 17, № 1. — С. 47–62. — DOI:10.1038/nrg.2015.10. — PMID 26666209.
6. Sai Luo, J. Yuyang Lu, Lichao Liu, et al., & Xiaohua Shen. Divergent lncRNAs Regulate Gene Expression and Lineage Differentiation in Pluripotent Cells // Cell Stem Cell. — 2020. — DOI:10.1016/j.stem.2016.01.024.

Профилактика

Специфическая профилактика COVID-19 (при помощи вакцины)в настоящее время находится в стадии разработки.

К неспецифической профилактике коронавируса относят:

• Изоляцию пациентов в отдельные боксы или палаты в инфекционном стационаре, где проводится уход и лечение. Выписка проводится после двух отрицательных результатов ПЦР-теста.
• Использование медицинских масок (необходимо менять их каждые 2 часа), применение средств индивидуальной защиты для медработников (защитный комбинезон и т.д.), дезинфекцию помещений, утилизацию медицинских отходов, транспортировку больных специальным транспортом.
• Своевременное обращение больных в медучреждения.
• Ограничение контактов на близком расстоянии.
• Соблюдение температурного режима и оптимальной влажности в помещении.
• Увлажнение слизистых оболочек верхних дыхательных путей.
• Регулярное мытье рук.

Также рекомендуется не посещать места большого скопления людей и регионы, где зарегистрированы вспышки заболевания.