Почему тест на коронавирус методом пцр дает разные результаты
Содержание:
- Экспресс-тест на коронавирус – расшифровка
- Кому следует пройти обследование
- Как делается экспресс-тест на коронавирус?
- Тонкости метода
- Особенности тестирования на дому
- Как пациенты узнают результаты?
- Экспресс-тест на коронавирус – достоверность
- «Точность ниже, чем у лабораторных тестов»
- Альтернатива ПЦР-диагностике
- Точность теста на коронавирус
- Сколько живет коронавирус
- А что за тесты на Covid-19, которые можно сделать самостоятельно на дому?..
- Что показывают результаты теста
- Делать ли экспресс-тест на коронавирус?
- Расшифровка результатов
Экспресс-тест на коронавирус – расшифровка
Кому следует пройти обследование
Обследование на коронавирусную инфекцию COVID‑19 при помощи тестирования нужно для таких групп населения:
- с симптомами ОРВИ (температура, боль в горле, кашель, заложенность носа, головная боль, общая слабость);
- вернувшимся из заграничных поездок, командировок;
- контактировавшим с зараженными дома или на работе, прибывшими из очагов пандемии (Китай, Иран, Южная Корея, США, Западная Европа, Украина, Белоруссия);
- с диагнозом пневмония;
- при сомнительных признаках респираторного заболевания (например, есть только сильная слабость) в возрасте от 60 лет и сопутствующими болезнями сердца, легких, диабетом, при онкологии;
- медработникам или контактирующим с зараженными в местах изоляции;
- находящимся в закрытых коллективах (например, дом-интернат, курсанты).
Участковым врачом или прибывшим на вызов скорой помощи могут быть определены и индивидуальные показания для обследования.
Тесты на коронавирус направлены на поиск вирусной РНК, а также антител в крови. Если их назначается врач, то они проводятся бесплатно, при самостоятельном обращении в клиники или вызове на дом сотрудника частной лаборатории необходима оплата. При положительном результате потребуется изоляция, а при наличии симптомов – лечение инфекции.
Как делается экспресс-тест на коронавирус?
Тонкости метода
В ПЦР-диагностике много нюансов, объясняет Алексей Чемерис. В лаборатории для научных целей выявляют даже единичные копии вирусного генома в образце, при массовом применении чувствительность обычно на порядки ниже.
«Из-за случайных мутаций генома праймеры могут не сработать, если однонуклеотидные замены или даже более значительные изменения генома вируса пришлись как раз на эти участки. Вероятность невысока, но она есть», — отмечает ученый.
Возможны сбои при ручных операциях, которых не так много. Одна из них — извлечение вирусной РНК из образца. Автоматический экстрактор нуклеиновых кислот стоит довольно дорого, поэтому обычно эту процедуру доверяют лаборанту. Редко, но ложноположительные результаты случаются, в том числе из-за особенностей ПЦР или загрязнения образца.
Чаще всего, однако, проблемы возникают до того, как пробирка попала в лабораторию. Вот что пишут авторы статьи в журнале «Вестник Росздравнадзора»: «В настоящее время имеются неопровержимые доказательства того, что преаналитическая фаза является основным источником ошибок в лабораторных исследованиях, когда они используются для диагностических или исследовательских целей». Они публикуют целый список нарушений, ведущих к ложноотрицательным результатам.
Ключевой этап — подготовка к исследованию. «За три часа до анализа нельзя есть, пить, курить и полоскать рот. Дело в том, что коронавирус поражает клетки слизистой оболочки дыхательных путей. Проникая в них, он начинает размножаться, накапливается на их поверхности. Но есть еще и эпителиальные клетки, которые часто обновляются. Вместе с водой, едой и избытком слюны при курении и жевании жвачки эпителиальные клетки попадают в пищевод. В результате вероятность обнаружить вирус в мазке падает практически до нуля», — комментирует Тамара Силкина, врач клинической лабораторной диагностики, директор по лабораторным технологиям «Гемотеста».
Не менее важна процедура взятия биоматериала. Если неверно выбрать точку для мазка, например, из-за кашля или рвотного рефлекса, на зонд может не попасть достаточное количество клеток. На результат также влияют нарушения технологии хранения, транспортировки образцов.
«Цена ошибки очень высока — процент выявляемости коронавирусной инфекции снизится, а скорость ее распространения вырастет. Люди, получившие ложноотрицательные результаты, будут чувствовать себя спокойно, выходить в общественные места и контактировать с окружающими», — уточняет представитель «Гемотеста».
Ключевой этап — подготовка к исследованию. «За три часа до анализа нельзя есть, пить, курить и полоскать рот. Дело в том, что коронавирус поражает клетки слизистой оболочки дыхательных путей. Проникая в них, он начинает размножаться, накапливается на их поверхности. Но есть еще и эпителиальные клетки, которые часто обновляются. Вместе с водой, едой и избытком слюны при курении и жевании жвачки эпителиальные клетки попадают в пищевод. В результате вероятность обнаружить вирус в мазке падает практически до нуля», — комментирует Тамара Силкина, врач клинической лабораторной диагностики, директор по лабораторным технологиям «Гемотеста».
Не менее важна процедура взятия биоматериала. Если неверно выбрать точку для мазка, например, из-за кашля или рвотного рефлекса, на зонд может не попасть достаточное количество клеток. На результат также влияют нарушения технологии хранения, транспортировки образцов.
«Цена ошибки очень высока — процент выявляемости коронавирусной инфекции снизится, а скорость ее распространения вырастет. Люди, получившие ложноотрицательные результаты, будут чувствовать себя спокойно, выходить в общественные места и контактировать с окружающими», — уточняет представитель «Гемотеста».
Особенности тестирования на дому
Для сдачи подобного рода анализа следует заранее договориться о выезде бригады или специалиста лаборатории, имеющей лицензию на проведение диагностики коронавируса COVID-19. Есть нюанс: частные лаборатории оказывают подобную услугу только особам, у которых отсутствуют признаки ОРВИ, и платно (около 1300 рублей, не считая затраты на выезд медицинского сотрудника и забор биоматериала).
В государственных лабораториях теоретически можно сделать тест бесплатно, но только при условии нахождения в группе риска и наличия направления врача. Тест в срочном порядке рекомендован следующим лицам:
- медицинским работникам, обсуживающим пациентов с наличием/подозрением на КОВИД;
- при возникновении симптоматики КВИ (гипертермия, одышка, сухой кашель, заложенность носа, потеря обоняния и снижение работы вкусового анализатора, затрудненное дыхание), если экспресс-тест на грипп оказался отрицательным;
- лицам, не имеющим признаков КОВИД-19, но контактирующим с подтвержденным больным;
- перед перелетом и по возвращении в страну;
- при госпитализации в стационар (по любой причине) и перед проведением плановой операции.
Когда не нужно проводить экспресс-тест:
- контакт с возможным носителем инфекции был менее 5 дней назад;
- положительный результат экспресс-анализа на грипп;
- отсутствие симптоматики, хорошее самочувствие, отсутствие оснований предполагать контакт с больным коронавирусом.
Необходимый биоматериал – отделяемое с поверхности носо- и ротоглотки. Результаты готовы в течение 3-7 дней.
Как пациенты узнают результаты?
Скорость определения специфического иммуноглобулина в крови человека составляет примерно 10-15 минут. Проводить анализ можно в условиях больницы или дома. Ответ будет дан сразу.
Значения результата анализа можно расшифровать по полоскам, которые проявляются после нанесения капли крови пациента:
Высветилась полоска напротив значения G – человек переболел и в крови содержатся антитела к вирусу.
Ярко высвечивается полоска напротив значения М – происходит активная выработка иммуноглобулина М, что свидетельствует об активном заражении вирусом. Требуется обратиться к врачу!
Появилась полоска напротив значения G и M — это значение говорит о ранее перенесенном заболевании или начинаете выздоравливать, но инфекция присутствует.
Нет полоски С на тесте на коронавирус? Полоска напротив C свидетельствует о рабочем состоянии теста. Если экспресс-тест показал значение IgG, IgM без полоски C, то результат теста недействительный. Нужно еще раз провести тестирование.
Расшифровка экспресс-теста
Экспресс-тест на коронавирус – достоверность
«Точность ниже, чем у лабораторных тестов»
— Использовать тесты на антитела для диагностики коронавируса нельзя, — заявляет директор научно-клинического центра прецизионной и регенеративной медицины КФУ Альберт Ризванов. — Их можно использовать только для того, чтобы ответить на вопрос о том, переболел человек ранее или нет, и выработались ли у него антитела. В целом у экспресс-тестов точность ниже, чем у лабораторных. В отличие от последних, они могут сказать только «да» или «нет», то есть, они не могут определить, к примеру, уровень антител. Вообще антитела, особенно на ранних этапах, детектируются не у всех пациентов, следовательно, экспресс-тесты нельзя использовать как диагностику.
Аналогичную позицию озвучивает заместитель премьер-министра РТ Лейла Фазлеева. В беседе с «Реальным временем» вице-премьер заявила, что для подтверждения наличия или отсутствия ковида необходимо пройти лабораторную диагностику, поскольку «экспресс-тесты являются скрининговыми и их результаты не должны использоваться в качестве единственного основания для подтверждения статуса инфекции».
Как пояснил Альберт Ризванов, экспресс-тесты определяют антитела IgM (вырабатываются в самом начале и указывают на активную фазу инфекции или же на то, что человек переболел совсем недавно) или IgG («взрослые» антитела, которые появляются к концу болезни). Само тестирование проходит по следующему алгоритму: берется капля крови, капается в специальное окошко на тест-полоске, а сверху наносится рабочий раствор. Результат готов уже через 8—10 минут. Одна полоска должна проявляться всегда — это значит, что тест сработал, две других полоски показывают антитела M и G.
Альтернатива ПЦР-диагностике
В любом случае нужно повышать чувствительность тест-систем на основе ПЦР, заключает Алексей Чемерис, а для этого нужны другие подходы. «Надо сделать так, чтобы ложнонегативных результатов было меньше, практически исключить их», — считает он.
В обзоре, подготовленном вместе с коллегами, профессор Чемерис рассматривает преимущества и недостатки ПЦР-диагностики и других методов амплификации — копировании РНК бетакоронавирусов, к которым относится SARS-CoV-2. Теоретически весьма перспективен метод петлевой амплификации — LAMP, где используют сразу шесть или восемь праймеров.
«С одной стороны, повышается специфичность: только когда все праймеры отожгутся (сработают, распознав РНК коронавируса. — Прим. ред.), начнется амплификация, с другой — вирус мутирует и шансы, что реакция не пойдет, увеличиваются, поскольку какие бы участки генома ни выбрать, все равно вероятность мутаций больше в восьми участках, чем в двух или трех (при использовании гибридизационного зонда), достаточных для ПЦР», — объясняет исследователь.
Во время предшествующей эпидемии SARS возбудителя выявляли с помощью реакции NASBA (амплификации на основе секвенирования нуклеиновых кислот) и RCA (репликации по типу катящегося кольца). Геномный редактор CRISPR-Cas также пробуют применять для идентификации РНК нового коронавируса. Есть работы по полногеномному секвенированию любого генетического материала, находящегося в биоматериале. Метод очень чувствительный, но дорогой и долгий — занимает 20 часов. Так что в ближайшее время ПЦР с обратной транскрипцией останется самым массовым способом обнаружения коронавируса в организме.
Точность теста на коронавирус
Тесты с помощью специальной аппаратуры все еще точнее
В зависимости от того, заразился ли кто-то совсем недавно, есть ли у него симптомы, или он уже выздоровел, у человека будет разное количество вируса в его организме. Чем ниже концентрация вируса, тем труднее его обнаружить. Другие тесты SARS-CoV-2 позволяют обойти эту проблему, создавая копии генетического материала в образце в надежде, что, если патоген присутствует, в конечном итоге он будет обнаружен.
Данные, представленные Abbott в администрацию по контролю за продуктами и лекарствами США, говорят о том, что в 97,1% случаев быстрый тест на коронавирус правильно идентифицирует человека с COVID-19. Пока неясно, работает ли это соотношение производительности в реальных условиях.
Сколько живет коронавирус
В то же время исследователи пытаются ответить на другой важный вопрос о COVID-19: сколько времени SARS-CoV-2 может находиться в организме человека, прежде чем он станет безопасным для других? С точки зрения борьбы с пандемией, способность человека передавать вирус другому человеку помогает определить, нужно ли ему самоизолироваться. Общепринятые «14 дней» зачастую не работают — некоторые заражают других и через месяц.
В любом случае этот тест заметно облегчит жизнь в пандемию коронавируса. Его стоимость и скорость позволяют легко тестировать большие группы, и даже ежедневное тестирование людей, которые контактировали с инфицированным человеком, играет большую роль. Например, так можно периодически тестировать детей в школе.
Возможно, именно этот тест поможет быстро выявить случаи COVID-19 в реальном мире и позволит лучше понять сам вирус. Либо же нашим спасением станет вакцина от коронавируса. Но где гарантии, что ее сделают все?
А что за тесты на Covid-19, которые можно сделать самостоятельно на дому?..
Это все тот же экспресс-анализ на вирусные антигены — быстрый, но не точный. Но вместо того, чтобы идти в медицинскую организацию, можно купить комплект анализа и проверить себя самостоятельно.
Есть один важный момент, на который стоит обратить внимание — такой тест стоит в среднем 2500 рублей, в то время как в том же Центре СПИД его могут сделать за 2 357 рублей… Стоит ли платить больше за анализ, который придется брать у себя самостоятельно? И который можно легко испортить, неправильно выполнив указания в инструкции?. Стоит также помнить, что анализ на антигены — самый неточный, даже если взять его правильно
Стоит также помнить, что анализ на антигены — самый неточный, даже если взять его правильно.
Есть еще один «самостоятельный» анализ — некоторые частные медицинские организации предлагают комплект теста ПЦР. Идея в том, что клиент приобретает комплект для самостоятельного взятия мазка из носо- и ротоглотки, берет у себя анализ, и потом относит запакованный материал в лабораторию компании, у которой он приобрел тест. То есть, с одной стороны, есть возможность сдать самый точный тест на платной основе. С другой — придется очень внимательно прочитать инструкцию и не допустить ошибок при запаковке биоматериала. В противном случае, деньги окажутся потрачены впустую.
Что показывают результаты теста
Исследование на антитела к коронавирусу показывает уровень двух видов иммуноглобулинов: IgM и IgG. Если тест качественный (в виде тест-полоски), будет результат “да” или “нет”
Полуколичественные методы ИФА показывают не только наличие антител, но и их уровень, что важно для врачей-эпидемиологов
Рассмотрим разные варианты результатов:
- IgM и IgG отрицательные — человек никогда не сталкивался с коронавирусом / антитела еще не успели выработаться / есть нарушения в работе иммунной системы;
- IgM положительный, IgG отрицательный — пациент болеет в данный момент (или переносит COVID-19 бессимптомно);
- IgM отрицательный, IgG положительный — коронавирусная болезнь перенесена в прошлом;
- IgM и IgG положительные — человек переболел недавно.
Важно! Тест на антитела не заменяет анализ ПЦР и не может использоваться для диагностики коронавирусной инфекции
Делать ли экспресс-тест на коронавирус?
На сегодняшний день экспресс-тесты на антитела к COVID-19 нельзя свободно приобрести в аптечной сети. Такой факт медики объясняют высокой вероятностью неправильной самостоятельной интерпретации результатов пациентами. В связи с этим в большинстве случаев тест проводят пациентам при наличии показаний. Тест-системы используют:
- Для диагностики коронавирусной инфекции у контактов первого уровня.
- С целью выявления этапа болезни у пациентов с клиническими проявлениями COVID-19.
- Для быстрого обследования медицинских работников, оказывающих помощь больным коронавирусом.
- Для определения наличия антител у пациентов, перенесших COVID-19, с целью оценки эпидемиологической ситуации.
Расшифровка результатов
Интерпретацией полученных данных занимается врач, который дал направление на диагностику. Если пациент самостоятельно решил пройти обследование, то с бланком следует обратиться к специалисту.
ПЦР
В бланке с результатами обычно значится одно слово – «положительный» либо «отрицательный». «Положительный» ответ говорит о наличии в организме человека возбудителя коронавирусной инфекции. Данные такого анализа обязательно передаются в лабораторный центр Министерства здравоохранения. Пациенту необходимо соблюдать условия самоизоляции и сообщить своему семейному врачу о положительном результате.
«Отрицательный» ответ говорит об отсутствии возбудителя КВИ в биоматериале, который был сдан в качестве образца для исследования. Такой итог не является диагнозом, а значит, если есть какие-либо признаки ОРВИ или острого респираторного синдрома, необходимо обратиться к врачу.
Тест на антитела
Ответы могут быть следующими:
- «первично положительный»;
- «положительный»;
- «отрицательный».
При «первично положительном» результате анализа на антитела IgA/IgМ/IgG специалисты советуют не впадать в панику, а пройти ПЦР-исследование на КОВИД-19. «Положительный» ответ говорит о том, что человек болен сейчас или был инфицирован в прошлом, что зависит от показателей той или иной группы иммуноглобулинов. Наличие иммуноглобулина М говорит об остром инфекционном процессе, то есть пациент болеет в данный момент времени. Если найдены иммуноглобулины M и G, это является свидетельством того, что особа уже переболела либо находится на этапе выздоровления.
IgM: < 1IgG: < 10 | IgM: от 1 до 2IgG: < 10 | IgM: ≥ 2IgG: < 10 | IgM: ≥ 2IgG: ≥ 10 | IgM: < 2IgG: ≥ 10 |
не сталкивался с вирусом | сомнительный результат | в стадии заболевания | сомнительный результат | переболел |
Интерпретация результатов исследования
К примеру, если по результатам теста выявлены показатели IgM: 1.42 и IgG: 154.15 — это означает, что человек переболел коронавирусом и у него выработался хороший иммунитет. Показатели IgM: 5.12 и IgG: 9.51 свидетельствуют о процессе заболевания и необходимости соблюдать самоизоляцию.
Следует помнить, что наличие антител в организме человека не говорит именно о том, что он болеет COVID-19. Это всего лишь косвенный признак, который необходимо подтвердить ПЦР-исследованием, поскольку не только коронавирус может вызывать иммунную реакцию организма, но и ряд других не менее опасных инфекций.
Экспресс-метод
На тесте есть контрольная линия (С), она в любом случае должна в ходе исследования закрашиваться. Если этого не происходит, значит, тест недействителен, возможно, бракован
Такие результаты во внимание не берутся. Отрицательный тест будет в том случае, если закрашенной окажется только контрольная линия, а остальные (IgM, IgG) останутся в своем первоначальном виде
Положительным считается ответ:
- закрашена линия IgM + контрольная;
- закрашена линия IgG + контрольная;
- обе линии закрашены + контрольная.
Важно! Интенсивность окрашивания линий может быть различной.