Пцр тест на коронавирус: как проводится и когда делается?

Метод петлевой изотермической амплификации, LAMP

Метод петлевой изотермической амплификации, LAMP (от англ.Loop-mediated isothermal amplification) считается упрощенной ПЦР. Производители тест-систем обещают точность метода до 94%.

Во многом метод LAMP схож с ПЦР, за исключением ряда нюансов: праймеров требуется больше, амплификаторов (приборов, периодически изменяющих температуру) не требуется вовсе, как не требуется и электрофореза. РНК вируса также достраивается до ДНК, а дальше копирование идет при постоянной температуре и занимает всего 20-30 минут.

Чтобы увидеть результат, не требуется электрофорез, достаточно просто взглянуть на пробирку. Мутный осадок говорит о том, что в образце обнаружен вирус. Осадок частично состоит из ионов, освобождающихся из «букв»-нуклеотидов во время синтеза ДНК. Если он появляется, значит, ДНК вируса удалось размножить. Многие производители добавляют в свои тест-системы флуоресцентные красители ДНК, чтобы наличие или отсутствие вирусной частицы не вызывало сомнений.

Reuters

Как сдаются тесты?

Исследование проводится с помощью оборудования, установленного в лабораториях.

На антитела

Принцип работы экспресс-теста близок к системе глюкометра. На основание пластины помещается капля крови, которая исследуется в течение 15-30 минут. Результат отражается в виде полосок при выявлении IgM или IgG. Преимущество метода заключается в скорости.

Метод ИФА требует больше времени по сравнению с ИХА, но и точность результата у него выше.

Перед обследованием измеряется температура и заполняется анкета с указанием хронических заболеваний, беременности и возможного контакта с зараженным.

ПЦР

В основе метода полимеразной цепной реакции лежит выделение и многократное копирование ДНК. После этой процедуры биоматериал проверяется на возбудителя. При выявлении его в пробе тест показывает положительный результат.

Вирус состоит из одноцепочечной молекулы РНК, а не двухцепочечной ДНК. Это усложняет и затягивает время диагностики ковид, ведь молекулу вируса-возбудителя сначала требуется преобразовать в ДНК.

Достоинства и недостатки метода ПЦР

Современные методы позволяют точно подобрать набор веществ, нужных для реакции, а значит, «достроить» именно ДНК SARS-Cov-2, а не другого похожего.

Теперь о недостатках. Первое — относительно высокая цена. Она обусловлена высокой себестоимостью как праймеров, так и оборудования – амплификаторов. Второе — время. Ждать, пока размножится ДНК, нужно несколько часов, а с учетом транспортировки до лаборатории результаты теста пациент может узнать через сутки и более.

Также эффективность теста не превышает 80%. Праймеры для реакции подбираются на основе информации об РНК вируса. Но фрагмент с теми же «буквами» может оказаться и в других микроорганизмах пробы – отсюда ложноположительный результат. Ложноотрицательный результат получится, если вирусные частицы ушли из ротоглотки, спустились дальше по дыхательному пути. Тогда в пробе просто не окажется РНК вируса.

Сдавать тест ПЦР есть смысл в том случае, если человек контактировал с пациентом с подтвержденным коронавирусом.